Computationele Chemie & Biologie – Pagina 2
-
Verdieping‘Wij hadden niet verwacht dat we dit in ons wetenschappelijk leven nog zouden zien’
Science en Nature beschouwen eiwitvouwing voorspellen met kunstmatige intelligentie als dé wetenschappelijke doorbraak van 2021. Wij spraken twee experts over deze ‘gigantische stap vooruit’.
-
Nieuws
Magnetische anisotropie manipuleren
RU-onderzoekers creëren meer fundamenteel begrip over het fascinerende verschijnsel magnetische anisotropie.
-
Nieuws
Science 2021 Breakthrough of the Year: Eiwitten vouwen met kunstmatige intelligentie
Wetenschappelijk tijdschrift Science benoemt AI aangedreven eiwitvouwvoorspelling tot ‘2021 Breakthrough of the Year’.
-
Verdieping
Kwantumeffecten in de biologie: a load of rubbish of de enige verklaring?
Verstrengeling, tunnelling en coherentie doen mogelijk ook hun werk in de warme, rommelige omgeving van de biologische cel.
-
Verdieping
Puzzelen naar biomarkers met MS en IR-lasers
Vergelijk je infraroodionspectroscopie-spectra met DFT-berekeningen, dan kun je heel gericht de precieze molecuulstructuur van biomarkers ontrafelen.
-
Nieuws
Halogenen te dik voor paradigma
Bindingssterkte tussen twee atomen leek voorheen volledig af te hangen van elektronegativiteit, maar dat blijkt niet altijd altijd het geval.
-
Nieuws
Nanopore sequencing-technologie nu ook geschikt voor eiwitten
Aminozuurvolgordes kun je nu bepalen met een aangepaste nanopore DNA sequencing-technologie, vond Cees Dekkers lab.
-
Verdieping
Eiwitten simuleren in je tussenjaar
Sophie Blinker werd de eerste auteur van een wetenschappelijke publicatie terwijl ze pas halverwege haar studie was.
-
Verdieping
Serendipiteit en kwantumchemie leiden tot nieuwe syntheseroute
Groningse onderzoekers vonden een manier om volledig gedeutereerd γ-valerolacton te maken uit ongelabeld α-angelicalacton.
-
Verdieping
Dossier: Kunstmatige intelligentie
Kunstmatige intelligentie zal het (bio)chemisch onderzoek ingrijpend veranderen, als het aan de talloze initiatieven van de laatste jaren ligt.
-
Media
Leon Smook – Kun je ruiken zonder neus?
Niet alle geuren zijn waar te nemen voor mensen. Daarom onderzoekt Leon Smook (Universiteit Twente) de mogelijkheden van een kunstmatige neus, die op moleculair niveau geuren kan identificeren. Hij vertelt je erover in 1 minuut!
-
Media
Trevor A. Hamlin – De mechanismes van een chemische reactie
Achter chemische reacties liggen een hoop mechanismes ten grondslag. Als je dit goed begrijpt, kun je deze kennis gebruiken voor het efficiënt en duurzaam ontwikkelen van producten. Trevor A. Hamlin onderzoekt en modelleert reacties met kwantumchemische simulaties.
-
Media
Barbara Zarzycka – Medicijnontwerp gebaseerd op 3D-structuur
Eiwitten hebben uiteenlopende functies die samenhangen met hun 3D-structuur. Voor medicijnen, die vaak aangrijpen op eiwitten, is die structuur ook heel belangrijk. Barbara Zarzycka (Vrije Universiteit Amsterdam) onderzoekt die interacties en probeert de werking van (toekomstige) medicijnen te voorspellen.
-
Verdieping
Het begin van de computationele chemie in Nederland
Dat de wetenschap inmiddels veelvuldig gebruikmaakt van simulaties, modellen en algoritmes is niet altijd zo geweest. Mede dankzij prof.dr. Wim Nieuwpoort (90) beschikken we in Nederland over een goede infrastructuur voor wetenschappelijk rekenen.
-
Verdieping
Fundamentele kennis voor een praktische neus
Papers publiceren is an sich niet heel bijzonder, maar wel als je nog student bent. Leon Smook wist tijdens zijn masterafstudeeropdracht in het coronajaar drie papers te publiceren. Je zou kunnen zeggen dat hij er een ‘neus’ voor heeft.
-
Verdieping
In zestig jaar kan een hoop veranderen voor studenten
Prof.dr. Wim Nieuwpoort is in mei negentig jaar geworden, Marjolein de Jager is in september 2020 begonnen met haar promotieonderzoek. Allebei houden ze zich bezig met computationeel onderzoek. Hoe kijken beide generaties naar hun studie en de computationele wetenschap?
-
Verdieping
Brug tussen theorie en experiment
Postdoc Thomas Hansen werkt met labjas én computer op de grens van experimentatie en theorie.
-
Verdieping
Paradigmashift in de organische chemie
Een paradigma in de organische chemie dat al sinds 1931 in gebruik is, blijkt niet te kloppen, vonden Amsterdamse wetenschappers. Niet koolstof s–p hybridisatie, maar sterische repulsie zorgt voor het variëren van bijvoorbeeld C–H-bindingslengten.
-
Nieuws
De kracht van computers voor biotechnologie, deel I
Met een rekenkracht die sinds de jaren zeventig volgens de Wet van Moore elke twee jaar verdubbelt, nemen de mogelijkheden voor biotech-onderzoek en -toepassingen toe.
-
Verdieping
Modelleur van de volgende uitbraak
‘Kunnen we de ontsnapping van een virus aan vaccinatie voorspellen?’ vraagt viroloog Sebastian Lequime zich af. Hij combineert next generation sequencing en brute computerkracht om de evolutie van virussen te reconstrueren.
