Computationele Chemie & Biologie – Pagina 5
-
Nieuws
Theorie ontvouwt DNA
In theorie kost het buigen van een dubbele DNA-helix minder energie dan gedacht. Monte-Carlosimulaties van zo’n streng werpen nieuw licht op praktijkwaarnemingen, schrijven John van Noort en collega’s van de Universiteit Leiden in het Biophysical Journal. Het gaat dan met name om het ‘vrije’ DNA dat twee zogeheten nucleosomen met ...
-
Nieuws
Synthetisch geheugen
Gentse onderzoekers hebben een nieuwe manier uitgewerkt om data op te slaan in organische ketenmoleculen. En dan bedoelen ze nadrukkelijk géén DNA, schrijven ze in Nature Communications. Volgens Filip Du Prez en collega’s kun je beter andere bouwstenen gebruiken die chemisch minder ingewikkeld zijn dan DNA en daardoor gemakkelijker te ...
-
Nieuws
DNA zet boom op
Uit vertakte DNA-fragmenten kun je boomachtige structuren opbouwen die als dragers kunnen dienen voor geneesmiddelen of gentherapie. Christos Likos en collega’s uit Wenen, Jülich en Ithaca, NY hebben het concept zowel theoretisch als experimenteel uitgewerkt, schrijven ze in het tijdschrift Nanoscale. Ze spreken van dendrimer-like DNA molecules, afgekort DL-DNA. De ...
-
Nieuws
Ultraporeus MOF
In Dresden is een metal-organic framework (MOF) gebouwd met een porievolume van 5,02 kubieke centimeter per gram. Een wereldrecord, juichen Stefan Kaskel en collega’s in Angewandte Chemie. Er hoort een specifiek porie-oppervlak bij van 7.800 m2 per gram, bijna tien keer zo veel als in de gemiddelde poreuze zeoliet. Van ...
-
Nieuws
Plant organiseert groeirichting
Wageningse onderzoekers denken te begrijpen waarom plantenkiemen één kant uit groeien. Een computersimulatie op basis van hun aannames geeft in elk geval precies hetzelfde resultaat, schrijven ze in Current Biology. Het is voor het eerst sinds het ontstaan van de celbiologie, meer dan honderd jaar geleden, dat iemand met een ...
-
Nieuws
Katalyse stapt af van trapje
Oneffenheden gelden als de katalytisch meest actieve plekken op een metaaloppervlak. Maar voor de dissociatie van waterstof op koper gaat die vuistregel niet op, onthulden Leidse onderzoekers onlangs in een hot paper in Physical Chemistry Chemical Physics. Ludo Juurlink en collega’s stelden zowel experimenteel als theoretisch vast dat H2 beter ...
-
Nieuws
Molecuul zit tuberculose dwars
Voor het eerst is er een middel tegen tuberculose dat géén antibioticum is. Het werkt in elk geval bij cavia’s, melden onderzoekers uit Manchester in het Journal of Medicinal Chemistry. De publicatie suggereert dat de behandeling het beste werkt in combinatie met bestaande antibiotica, maar dat je haar ook ‘los’ ...
-
Nieuws
Chemie helpt kwantumfysica
Grafeennanolinten van een paar zesringen breed staan volop in de belangstelling vanwege ‘topologische’ eigenschappen die bepalen of en hoe ze elektronen doorgeven. Om dit te bestuderen moet de koolstofstructuur perfect zijn. Dat bereik je alleen door de linten chemisch te synthetiseren. Je gaat uit van diverse uitgekiende bouwstenen, elk met ...
-
Nieuws
Kankercel kan het zuur krijgen
Tumorcellen hebben goede redenen om hun inwendige pH te verhogen. En de oncologie heeft dus goede redenen om die te verlagen, blijkt uit computerberekeningen die zojuist verschenen in Nature Communications. Dát die pH in een kankercel hoger is dan daarbuiten, terwijl het bij gezonde cellen precies omgekeerd is, wisten we ...
-
Nieuws
Griekse beginselen doen MOF verstijven
Metal-organic frameworks zijn te verstevigen door de organische componenten te ‘decoreren’ met op het eerste gezicht nutteloze tierelantijnen. Noem het maar chemische kariatiden, schrijven Berend Smit en collega’s in ACS Central Science. Ze verwijzen daarmee naar de zuilen in de vorm van een vrouw, die de oude Grieken nu en ...
-
Nieuws
Koorts jaagt klokfrequentie immuunsysteem op
Koorts laat een radertje van de biologische klok sneller lopen en versnelt zo de respons op infecties. De vraag is nu of je dat radertje ook op temperatuur-onafhankelijke wijze een zetje kunt geven, suggereert een Engelse publicatie in PNAS. Volgens laatste auteur Mike White, van de University of Liverpool, zou ...
-
Nieuws
Roeren in de bitcoins
Wiskundig gezien blijken er treffende overeenkomsten te zijn tussen bitcointransacties en vloeistofdynamica. Je kunt dus je cryptogeld beschermen met formules waar je normaal gesproken het roeren in je koffie mee beschrijft, schrijft Stanford-promovendus William Gilpin in PNAS. Die bescherming werkt met zogeheten hashfuncties, een cryptografische techniek die het vrijwel onmogelijk ...
-
Nieuws
138 miljoen voor onderzoeksinfrastructuur
NWO deelt € 138 miljoen uit voor de realisering van tien grootschalige onderzoeksfaciliteiten. De bulk gaat via-via naar de moleculaire wetenschappen, werd vandaag duidelijk. Het grootste bedrag, € 19,5 miljoen, gaat naar het instituut voor ruimte-onderzoek SRON als bijdrage aan de Europese ruimtetelescoop Athena (zie de afbeelding). Die moet vanaf ...
-
Nieuws
Wordt de organicus weggeautomatiseerd?
Goedgetrainde neurale netwerken kunnen nu organische syntheseroutes bedenken die zo goed zijn dat zelfs een doorgewinterde syntheticus het verschil niet meer ziet met het klassieke handwerk. Dat claimen Duitse onderzoekers deze week in Nature. De Nature-redactie plaatste er een commentaar bij van Derek Lowe, dankzij zijn blogs en columns misschien ...
-
Nieuws
Twee smaken ijskoud water
Vloeibaar water kent een fase-overgang bij 80 graden onder nul. Tot voor kort alleen in theorie maar nu ook in de praktijk, meldt UvA-hoogleraar Sander Woutersen in Science. Op de preprintserver arXiv.org verscheen al eerder een ruwe versie van het manuscript. Waarbij zijn grootste prestatie uiteraard is dat hij dat ...
-
Nieuws
Neuzen in je genoom
In Nature Genetics presenteren Leuvense en Amerikaanse onderzoekers zeven genen die de vorm van je neus helpen bepalen. Handig als je een gezicht wilt reconstrueren op basis van een schedel, stelt eerste auteur Peter Claes in een persbericht. Zo’n neus bestaat voornamelijk uit kraakbeen en is gewoonlijk allang verdwenen als ...
-
Nieuws
Computer voorspelt collaterale CRISPR-schade
In Delft is een wiskundig model ontwikkeld dat de kans voorspelt op fouten bij het editen van genen met CRISPR-Cas. Zo kun je een knipplek zoeken met een minimale kans op ongelukjes, schrijven Martin Depken en collega’s in Cell Reports. Die ongelukjes houden in dat het Cas9-knipeiwit niet de unieke ...
-
Nieuws
Origins Center klaar voor de start
Afgelopen zomer zegde onderzoeksfinancier NWO een startsubsidie van € 2,5 miljoen toe. Hiermee kan het Origins Center de komende drie jaar enkele postdocs prangende deelvragen op het gebied van de herkomst van leven in het universum laten onderzoeken.
-
Nieuws
Spelen met de puntwolk
Moeilijk te karakteriseren oppervlakken in emulsies zijn met een microscopietruc en de computer alsnog zichtbaar te maken, ontdekte materiaalwetenschapper Antonio Aloi aan de TU/e. Superresolutiemicroscopie is een ware revolutie geweest voor de blik op alle materialen. Nou ja: bijna alle. Hoewel de techniek het plots mogelijk maakte om eiwitten, ...
-
Nieuws
Sneeuwvlok wortelt in entropie
Nano-ijskristallen hebben een heel andere structuur dan gedacht, en in wolken vormen ze zich daardoor 1.800 keer sneller dan de huidige rekenmodellen voorspellen. Weer- en klimaatvoorspellingen moeten dus wat dat betreft op de schop, stellen Valeria Molinero en collega’s van de University of Utah in Nature. Op grotere schaal is ...