Computationele Chemie & Biologie – Pagina 6

  • Nieuws

    Origins Center klaar voor de start

    2017-11-27T05:00:00Z

    Afgelopen zomer zegde onderzoeksfinancier NWO een startsubsidie van € 2,5 miljoen toe. Hiermee kan het Origins Center de komende drie jaar enkele postdocs prangende deelvragen op het gebied van de herkomst van leven in het universum laten onderzoeken.

  • Nieuws

    Spelen met de puntwolk

    2017-11-27T04:59:00Z

    Moeilijk te karakteriseren oppervlakken in emulsies zijn met een microscopietruc en de computer alsnog zichtbaar te maken, ontdekte materiaalwetenschapper Antonio Aloi aan de TU/e. Superresolutiemicroscopie is een ware revolutie geweest voor de blik op alle materialen. Nou ja: bijna alle. Hoewel de techniek het plots mogelijk maakte om eiwitten, ...

  • Nieuws

    Sneeuwvlok wortelt in entropie

    2017-11-09T08:05:00Z

    Nano-ijskristallen hebben een heel andere structuur dan gedacht, en in wolken vormen ze zich daardoor 1.800 keer sneller dan de huidige rekenmodellen voorspellen. Weer- en klimaatvoorspellingen moeten dus wat dat betreft op de schop, stellen Valeria Molinero en collega’s van de University of Utah in Nature. Op grotere schaal is ...

  • Nieuws

    Gesmolten MOF

    2017-10-10T09:21:00Z

    Als metal-organic frameworks smelten, behouden ze soms hun structuur. Ze gedragen zich dan als poreuze vloeistoffen, schrijft de Parijse onderzoeker François-Xavier Coudert in Nature Materials. Tot nu toe bestudeert iedereen die MOF’s eigenlijk alleen in de vorm van vaste kristallen. Er zijn er wel eens een paar gesmolten, onder een ...

  • Nieuws

    Aluminium dat op water drijft

    2017-09-25T11:50:00Z

    Theoretisch kun je aluminium maken met een soortelijke massa van 0,61. In die vorm zou het dus moeten drijven op water, schrijven Russische onderzoekers in het Journal of Physical Chemistry C. Hoe je dit ‘supertetraëdrische’ aluminium ooit in de praktijk zou moeten realiseren, schijnen Alexander Boldyrev (tegenwoordig University of Utah, ...

  • Nieuws

    Oplosbaarheid beter voorspelbaar

    2017-08-24T16:12:00Z

    UvA-onderzoekers hebben een model ontwikkeld dat de oplosbaarheid van kleine moleculen in specifieke oplosmiddelen beter dan ooit voorspelt. Handig als je het optimale oplosmiddel zoekt voor een nieuw industrieel productieproces, schrijven Gadi Rothenberg en collega’s in ChemPhysChem. De laatste 50 jaar kwam men op dit gebied niet veel verder dan ...

  • Nieuws

    Synthetisch eiwit doet wat computer belooft

    2017-08-22T15:24:00Z

    Voor het eerst is een volledig synthetisch eiwit ontworpen dat een klein molecuul in vitro precies zo bindt als op de tekentafel. Het kán dus wel, stellen William DeGrado en collega’s van Duke University in Nature Chemistry. PS1 (porphyrin-binding sequence 1) bestaat uit 109 aminozuren en bindt een soort heemverbinding, ...

  • Nieuws

    DNA-virus infecteert computer

    2017-08-10T09:57:00Z

    In synthetisch DNA kun je een virus verstoppen dat via de sequencing-software een computernetwerk infecteert. Het is Tadayoshi Kohno en collega’s van de University of Washington daadwerkelijk gelukt, stellen ze in een paper dat ze volgende week presenteren tijdens een symposium over computerveiligheid in Vancouver. Kennelijk kun je zo’n synthetische ...

  • Nieuws

    Labrobot overtroeft mens

    2017-08-04T16:15:00Z

    Er zijn vormen van chemie die robots nu al beter beheersen dan mensen. Bijvoorbeeld het laten uitkristalliseren van gigantische polyoxometalaten, melden Lee Cronin en collega’s van de University of Glasgow in Angewandte Chemie. Die polyoxometalaten zijn bizarre structuren, opgebouwd uit zuurstof- en overgangsmetaalionen. Je kunt ze zo groot en ingewikkeld ...

  • Nieuws

    Katalyse biedt kansen voor kwantumcomputer

    2017-07-06T10:46:00Z

    Rekenen aan complexe chemische reactiemechanismes zou zomaar een killer application van kwantumcomputers kunnen worden. Op papier ziet het er in elk geval goed uit, schrijven Matthias Troyer en collega’s van Microsoft en de ETH Zürich in een publicatie die deze week door PNAS online is gezet. Een eerdere niet-gepeerreviewde versie ...

  • Opinie & Analyse

    Focus op software

    2017-07-03T06:00:00Z

    De chemie en life sciences kunnen niet meer zonder wetenschappelijke software. Maar hoe staat het met de erkenning van de ontwikkeling ervan binnen de academische wereld? Vier kenners praten mee. ‘De ontwikkeling van wetenschappelijke softwaretools wordt steeds belangrijker binnen de chemie en life sciences’, stelt Lars Ridder van het Netherlands ...

  • Nieuws

    Vingerafdruk voor nanoporiën

    2017-05-24T17:11:00Z

    In Zwitserland is een algoritme ontwikkeld dat de nanoporiestructuren van totaal verschillende materialen onderling vergelijkt. Zo kun je de juiste maat uit een database halen zonder meteen aan één bepaald materiaal vast te zitten, blijkt uit een publicatie in Nature Communications. Die poriestructuur, dus de combinatie van diameter en vorm, ...

  • Nieuws

    Dataopslag in vier chemische kleuren

    2017-05-24T16:46:00Z

    Onderzoekers uit Ohio hebben een chemie-gebaseerd optisch quaternair dataopslagsysteem ontwikkeld: een polymeer met twee kleine moleculen. Dat melden ze in het Journal of Materials Chemistry C. Er is steeds meer behoefte aan efficiëntere dataopslag. Optische dataopslag (zoals CD’s en Blu-Ray) is erg interessant door de lage kosten, hoge capaciteit en ...

  • Nieuws

    Hoe je antibiotica bouwt

    2017-05-11T12:40:00Z

    Om door de celwand van Gram-negatieve bacteriën te kunnen dringen moet een molecuul stijf, plat en een primair amine zijn. Op basis van die ontwerpregels kun je efficiënt nieuwe antibiotica ontwerpen, schrijven Paul Hergenrother en collega’s van de universiteit van Illinois in Nature. Ze hebben het gedemonstreerd door deoxynybomycine (DNM) ...

  • Nieuws

    Hoe een komeet zuurstof genereert

    2017-05-08T17:21:00Z

    Dat kometen moleculaire zuurstof genereren, is niet zo gek. Met een Eley-Ridealmechanisme kun je het uitstekend verklaren, schrijft Caltech-procestechnoloog Konstantinos Giapis in Nature Communications. De Rosetta-sonde ontdekte die zuurstof twee jaar geleden in de nevel rond de komeet 67P/Churyumov-Gerasimenko. Chemisch gezien was dat een verrassing: in het heelal is O2 ...

  • Nieuws

    Chemie ging digitaal

    2017-05-08T06:00:00Z

    Feiten en anekdotes uit de begintijd van het computer­tijdperk in Nederland. Om katalytische reacties te simuleren en polymeereigenschappen te voorspellen, bestelde BASF dit voorjaar bij Hewlett-Packard een van de grootste supercomputers ter wereld. En het is niet voor het eerst dat de chemie op dit gebied vooroploopt, zo blijkt uit ...

  • Nieuws

    Chemisch computergeheugen

    2017-05-05T11:29:00Z

    In Polen is bedacht hoe je databits opslaat in chemische klokreacties. Noem ze dan dus maar ‘chits’, stellen Konrad Gizynski en Jerzy Gorecki. In Physical Chemistry Chemical Physics onthulden ze onlangs hun chemische geheugen. Het werkt met een zogeheten Belousov-Zhabotinskyreactie, afgekort BZ, een klassiek voorbeeld van een oscillerende ...

  • Nieuws

    Femtochemische kernfusie

    2017-03-03T10:10:00Z

    Kernfusie gaat veel makkelijker als de betrokken kernen al samen in één molecuul zitten. In elk geval in theorie, claimen Amerikaanse en Chileense chemici. Hun berekeningen verschenen zojuist in een speciaal nummer van Chemical Physical Letters, opgedragen aan de vorig jaar overleden Nobelprijswinnaar Ahmed Zewail. Die geldt als vader van ...

  • Nieuws

    Nitraat blijkt zuur

    2017-02-22T15:15:00Z

    Onder bijzondere omstandigheden kunnen nitraationen reageren als Lewiszuren. En dat beïnvloedt op een onverwachte manier de structuur van sommige eiwitten, schrijft UvA-onderzoeker Tiddo Mooibroek in Nature Communications. Dat NO3- een (geconjugeerde) base is, zij het een zwakke, is dus alweer een dogma dat de prullenmand in kan. Mooibroek vermoedt dat ...

  • Nieuws

    Bayesiaanse eiwitstructuurbepaling

    2017-02-08T10:02:00Z

    Cryo-eletronenmicroscoopopnames van eiwitten herleiden tot een 3D-structuur wordt stukken eenvoudiger dankzij twee nieuwe algoritmes. Het kan nu binnen een paar uur op een gewone desktop-pc, beloven Canadese onderzoekers in Nature Methods. Met die ‘cryo-EM’-techniek kun je de structuur bepalen van losse eiwitmoleculen, zonder dat je ze eerst hoeft te laten ...