Computationele Chemie & Biologie – Pagina 6
-
Nieuws
Wordt de organicus weggeautomatiseerd?
Goedgetrainde neurale netwerken kunnen nu organische syntheseroutes bedenken die zo goed zijn dat zelfs een doorgewinterde syntheticus het verschil niet meer ziet met het klassieke handwerk. Dat claimen Duitse onderzoekers deze week in Nature. De Nature-redactie plaatste er een commentaar bij van Derek Lowe, dankzij zijn blogs en columns misschien ...
-
Nieuws
Twee smaken ijskoud water
Vloeibaar water kent een fase-overgang bij 80 graden onder nul. Tot voor kort alleen in theorie maar nu ook in de praktijk, meldt UvA-hoogleraar Sander Woutersen in Science. Op de preprintserver arXiv.org verscheen al eerder een ruwe versie van het manuscript. Waarbij zijn grootste prestatie uiteraard is dat hij dat ...
-
Nieuws
Neuzen in je genoom
In Nature Genetics presenteren Leuvense en Amerikaanse onderzoekers zeven genen die de vorm van je neus helpen bepalen. Handig als je een gezicht wilt reconstrueren op basis van een schedel, stelt eerste auteur Peter Claes in een persbericht. Zo’n neus bestaat voornamelijk uit kraakbeen en is gewoonlijk allang verdwenen als ...
-
Nieuws
Computer voorspelt collaterale CRISPR-schade
In Delft is een wiskundig model ontwikkeld dat de kans voorspelt op fouten bij het editen van genen met CRISPR-Cas. Zo kun je een knipplek zoeken met een minimale kans op ongelukjes, schrijven Martin Depken en collega’s in Cell Reports. Die ongelukjes houden in dat het Cas9-knipeiwit niet de unieke ...
-
Nieuws
Origins Center klaar voor de start
Afgelopen zomer zegde onderzoeksfinancier NWO een startsubsidie van € 2,5 miljoen toe. Hiermee kan het Origins Center de komende drie jaar enkele postdocs prangende deelvragen op het gebied van de herkomst van leven in het universum laten onderzoeken.
-
Nieuws
Spelen met de puntwolk
Moeilijk te karakteriseren oppervlakken in emulsies zijn met een microscopietruc en de computer alsnog zichtbaar te maken, ontdekte materiaalwetenschapper Antonio Aloi aan de TU/e. Superresolutiemicroscopie is een ware revolutie geweest voor de blik op alle materialen. Nou ja: bijna alle. Hoewel de techniek het plots mogelijk maakte om eiwitten, ...
-
Nieuws
Sneeuwvlok wortelt in entropie
Nano-ijskristallen hebben een heel andere structuur dan gedacht, en in wolken vormen ze zich daardoor 1.800 keer sneller dan de huidige rekenmodellen voorspellen. Weer- en klimaatvoorspellingen moeten dus wat dat betreft op de schop, stellen Valeria Molinero en collega’s van de University of Utah in Nature. Op grotere schaal is ...
-
Nieuws
Gesmolten MOF
Als metal-organic frameworks smelten, behouden ze soms hun structuur. Ze gedragen zich dan als poreuze vloeistoffen, schrijft de Parijse onderzoeker François-Xavier Coudert in Nature Materials. Tot nu toe bestudeert iedereen die MOF’s eigenlijk alleen in de vorm van vaste kristallen. Er zijn er wel eens een paar gesmolten, onder een ...
-
Nieuws
Aluminium dat op water drijft
Theoretisch kun je aluminium maken met een soortelijke massa van 0,61. In die vorm zou het dus moeten drijven op water, schrijven Russische onderzoekers in het Journal of Physical Chemistry C. Hoe je dit ‘supertetraëdrische’ aluminium ooit in de praktijk zou moeten realiseren, schijnen Alexander Boldyrev (tegenwoordig University of Utah, ...
-
Nieuws
Oplosbaarheid beter voorspelbaar
UvA-onderzoekers hebben een model ontwikkeld dat de oplosbaarheid van kleine moleculen in specifieke oplosmiddelen beter dan ooit voorspelt. Handig als je het optimale oplosmiddel zoekt voor een nieuw industrieel productieproces, schrijven Gadi Rothenberg en collega’s in ChemPhysChem. De laatste 50 jaar kwam men op dit gebied niet veel verder dan ...
-
Nieuws
Synthetisch eiwit doet wat computer belooft
Voor het eerst is een volledig synthetisch eiwit ontworpen dat een klein molecuul in vitro precies zo bindt als op de tekentafel. Het kán dus wel, stellen William DeGrado en collega’s van Duke University in Nature Chemistry. PS1 (porphyrin-binding sequence 1) bestaat uit 109 aminozuren en bindt een soort heemverbinding, ...
-
Nieuws
DNA-virus infecteert computer
In synthetisch DNA kun je een virus verstoppen dat via de sequencing-software een computernetwerk infecteert. Het is Tadayoshi Kohno en collega’s van de University of Washington daadwerkelijk gelukt, stellen ze in een paper dat ze volgende week presenteren tijdens een symposium over computerveiligheid in Vancouver. Kennelijk kun je zo’n synthetische ...
-
Nieuws
Labrobot overtroeft mens
Er zijn vormen van chemie die robots nu al beter beheersen dan mensen. Bijvoorbeeld het laten uitkristalliseren van gigantische polyoxometalaten, melden Lee Cronin en collega’s van de University of Glasgow in Angewandte Chemie. Die polyoxometalaten zijn bizarre structuren, opgebouwd uit zuurstof- en overgangsmetaalionen. Je kunt ze zo groot en ingewikkeld ...
-
Nieuws
Katalyse biedt kansen voor kwantumcomputer
Rekenen aan complexe chemische reactiemechanismes zou zomaar een killer application van kwantumcomputers kunnen worden. Op papier ziet het er in elk geval goed uit, schrijven Matthias Troyer en collega’s van Microsoft en de ETH Zürich in een publicatie die deze week door PNAS online is gezet. Een eerdere niet-gepeerreviewde versie ...
-
Opinie & Columns
Focus op software
De chemie en life sciences kunnen niet meer zonder wetenschappelijke software. Maar hoe staat het met de erkenning van de ontwikkeling ervan binnen de academische wereld? Vier kenners praten mee. ‘De ontwikkeling van wetenschappelijke softwaretools wordt steeds belangrijker binnen de chemie en life sciences’, stelt Lars Ridder van het Netherlands ...
-
Nieuws
Vingerafdruk voor nanoporiën
In Zwitserland is een algoritme ontwikkeld dat de nanoporiestructuren van totaal verschillende materialen onderling vergelijkt. Zo kun je de juiste maat uit een database halen zonder meteen aan één bepaald materiaal vast te zitten, blijkt uit een publicatie in Nature Communications. Die poriestructuur, dus de combinatie van diameter en vorm, ...
-
Nieuws
Dataopslag in vier chemische kleuren
Onderzoekers uit Ohio hebben een chemie-gebaseerd optisch quaternair dataopslagsysteem ontwikkeld: een polymeer met twee kleine moleculen. Dat melden ze in het Journal of Materials Chemistry C. Er is steeds meer behoefte aan efficiëntere dataopslag. Optische dataopslag (zoals CD’s en Blu-Ray) is erg interessant door de lage kosten, hoge capaciteit en ...
-
Nieuws
Hoe je antibiotica bouwt
Om door de celwand van Gram-negatieve bacteriën te kunnen dringen moet een molecuul stijf, plat en een primair amine zijn. Op basis van die ontwerpregels kun je efficiënt nieuwe antibiotica ontwerpen, schrijven Paul Hergenrother en collega’s van de universiteit van Illinois in Nature. Ze hebben het gedemonstreerd door deoxynybomycine (DNM) ...
-
Nieuws
Hoe een komeet zuurstof genereert
Dat kometen moleculaire zuurstof genereren, is niet zo gek. Met een Eley-Ridealmechanisme kun je het uitstekend verklaren, schrijft Caltech-procestechnoloog Konstantinos Giapis in Nature Communications. De Rosetta-sonde ontdekte die zuurstof twee jaar geleden in de nevel rond de komeet 67P/Churyumov-Gerasimenko. Chemisch gezien was dat een verrassing: in het heelal is O2 ...
-
Nieuws
Chemie ging digitaal
Feiten en anekdotes uit de begintijd van het computertijdperk in Nederland. Om katalytische reacties te simuleren en polymeereigenschappen te voorspellen, bestelde BASF dit voorjaar bij Hewlett-Packard een van de grootste supercomputers ter wereld. En het is niet voor het eerst dat de chemie op dit gebied vooroploopt, zo blijkt uit ...