Computationele Chemie & Biologie – Pagina 7
-
Nieuws
Gelaagde genetische code
In de manier waarop DNA zichzelf oprolt, zit een tweede erfelijke code verstopt die net zo goed aan evolutie onderhevig is als de code die we al kenden. Biologen voelden dat misschien al aan hun water maar computersimulaties van Leidse en Delftse fysici bewijzen dat het theoretisch ook ...
-
Nieuws
Kwantumdot past in computer
Voor het eerst is de uitwisseling van metaalionen op kwantumdots realistisch te simuleren op de computer. Dankzij softwarematige ‘pseudoliganden’ kun je nu tenminste voorspellen wat er gebeurt als je het recept verandert, melden Utrechtse en Delftse onderzoekers. Die uitwisseling houdt bijvoorbeeld in dat je de buitenste loodatomen in ...
-
Nieuws
Enzym met kurk
Het enzym autotaxine wordt geregeld door galzouten die werken als een soort kurk. Dat kan de ontstekingsremmende werking van die zouten op zijn minst gedeeltelijk verklaren, claimen onderzoekers van het NKI en het AMC in Nature Communications. Dat autotaxine (ATX) zet lysofosfaditylcholine om in lysofosfatidezuur (LPA), een lipide ...
-
Nieuws
Sjorren aan herinneringen
Ons langetermijngeheugen werkt mechanisch, met actinevezels als drijvende kracht en prion-eiwitten als opslagmedium. Tenminste, als de berekeningen kloppen die onderzoekers van Rice University (VS) zojuist publiceerden in PNAS. Het zou verklaren waarom zenuwcellen überhaupt prion-eiwitten bevatten. We weten dat die ziektes als Creutzfeldt-Jakob veroorzaken wanneer er iets fout ...
-
Nieuws
Anorganisch anti-aromatisch
Voor het eerst is het gelukt een volledig anorganische anti-aromatische verbinding in handen te krijgen. Chemici moeten dus nodig af van het idee dat aromaticiteit puur iets voor organici is, suggereert een publicatie in Angewandte Chemie. Uiteraard heeft in de definities van ‘aromatisch’ en ‘anti-aromatisch’ ook nooit gestaan ...
-
Nieuws
Computer zoekt hiv-vaccin
Onderzoekers van Vanderbilt University denken te weten hoe ze de ontwikkeling van een preventief vaccin tegen hiv-besmetting moeten aanpakken. Kwestie van slim gebruik maken van de antilichamen die mensen toch al aanmaken, blijkt uit een publicatie in PNAS.Het probleem met dat hiv is dat het zeer frequent muteert, en dat ...
-
Nieuws
Genetische programmeertaal
Zoals je computerchips ontwerpt, kun je ook genetische circuits in elkaar zetten. De programmeertaal blijft ongeveer hetzelfde, blijkt uit een publicatie in Science. Volgens MIT-promovendus Alec Nielsen en zijn begeleider Christopher Voigt hoef je zo geen verstand meer te hebben van genetica om een bacterie te ...
-
Nieuws
DNA maakt maatwerk van liposomen
Met DNA-origami als slabloon kun je liposomen exact op maat fabriceren. En misschien ook wel andere vormpjes met een imitatie-celmembraan er omheen, schrijven Amerikaanse onderzoekers in Nature Chemistry. Zulke liposomen zijn bolletjes die ontstaan door zelfassemblage van lipiden, dezelfde moleculen waaruit ook celmembranen zijn opgebouwd. Ze hebben onder ...
-
Nieuws
Cesiumion bindt er 16 tegeljk
Voor het eerst is een cesiumcomplex uitgekristalliseerd waarin elk cesiumion wordt omringd door zestien fluorionen. Het absolute maximum, zo meldden Klaus-Richard Pörschke en collega’s van het Max-Planck-Institut für Kohlenforschung in Mülheim/Ruhr tijdens het voorjaarscongres van de American Chemical Society in San Diego. Meer dan zestien bindingen is onmogelijk ...
-
Nieuws
Golvende vanderwaalskrachten
Vanderwaalskrachten tussen nanostructuren moet je omschrijven als interacties van ladingsdichtheidsfluctuaties met een golfkarakter. Rekenen met deeltjes die elkaar aantrekken en afstoten is op nanoschaal te simpel, blijkt uit internationaal onderzoek dat zojuist verscheen in Science. Tot nu toe rekent met juist wél op die manier, meestal via zogeheten ...
-
Nieuws
Eiwitcomputer rekent parallel
Met motoreiwitten kun je een biologische computer aandrijven die sommige wiskundige problemen sneller oplost dan een klassieke microprocessor. Het eerste prototype werkt al, meldt een internationaal gezelschap in PNAS. Het gaat dan met name om situaties waarbij je een hoop berekeningen tegelijk kunt doen. Kort door de bocht ...
-
Nieuws
Echt laag hangend farma-fruit
Het klopt dat in de farma-R&D het laaghangende fruit is geplukt. Maar de definitie van ‘fruit’ behoeft enige aanpassing, zo blijkt wanneer je beslismodellen uit de economische wetenschappen loslaat op lifescience-onderzoeksprocedures. Het pleidooi van Oxford-onderzoeker Jack Scannell en de Amerikaanse consultant Jim Bosley draait om ‘predictive validity’ (PV). ...
-
Nieuws
Superlicht ijs
Er moeten ijskristallen bestaan die een kwart lichter zijn dan het huidige record. Alleen zijn ze nogal moeilijk te maken, blijkt uit simulaties die zijn uitgevoerd aan de University of Nebraska-Lincoln. Als het echt blijkt te bestaan, zou ‘s-III ijs’ de achttiende bekende kristalstructuur van vast H2O zijn. ...
-
Nieuws
4D-print trekt voorspelbaar krom
Harvard-onderzoekers hebben een techniek ontwikkeld om 3D-prints te maken die op een voorspelbare manier vervormen bij contact met vocht. Net als levende planten doen, schrijven Jennifer Lewis en collega’s in Nature Materials. Ze omschrijven het als ‘biomimetisch 4D-printen’, waarbij tijd de vierde dimensie is. Je zou er bijvoorbeeld ...
-
Nieuws
Vast wel vaste waterstof
Bij 325 gigapascal en 300 K laat waterstof een nog onbekende fase-overgang zien. Waarschijnlijk wordt het nog net geen metaal maar zit het er dicht tegenaan, melden onderzoekers uit Edinburgh in Nature Materials. Eugene Gregoryanz en collega’s weten nog niet precies hoe de nieuwe fase, die ze fase ...
-
Nieuws
Massaspectrometrie geeft wijnvat smaak
Met massaspectrometrie kun je in realtime zien of een eikenhouten vat rijp is voor de drank die je er in wilt laten rijpen. Zo heb je de uiteindelijke smaak veel beter in de hand, claimen Tasmaanse en Zwitserse onderzoekers in Scientific Reports. Tijdens de productie van zulke vaten ...
-
Nieuws
RNA bevestigt bloedvergiftiging
Aan RNA in het bloed kun je snel het verschil zien tussen bloedvergiftiging en een systemische ontsteking die niet door een bacteriële infectie is veroorzaakt. Zo weet je tenminste of je de doodzieke patiënt antibiotica moet geven of juist niet, melden Amerikaanse, Australische en Nederlandse onderzoekers in PLOS ...
-
Nieuws
2D-boor als ideale monolaag
Chinese onderzoekers hebben voor het eerst een tweedimensionale monolaag van puur boor gemaakt, schrijven zij in Angewandte Chemie. De verwachtingen van dit materiaal zijn hoog vanwege verwachte chemische stabiliteit in lucht, hoge hardheid en bruikbaarheid als halfgeleider. De groep van de Nanjing University of Aeronautics and Astronautics onder ...
-
Nieuws
Taal verraadt sjoemelwetenschap
Zelfs bij bètawetenschappelijke publicaties kun je uit het taalgebruik de kans afleiden dat de auteurs frauderen met hun data. In principe moet je een algoritme kunnen schrijven dat manusctripten hier op checkt, stellen Stanford-onderzoekers David Markowitz en Jeff Hancock. Ze stellen dat wetenschappelijke fraudeurs geen haar beter zijn ...
-
Nieuws
Hersens op een chip
Uit stamcellen kun je op een chip iets kweken dat voldoende op menselijk hersenweefsel lijkt om er de toxiciteit van chemicaliën op uit te testen. Kan een hoop proefdieren schelen, beloven Michael Schwartz, James Thomson en collega’s van de University of Wisconsin-Madison. Het kweken gaat veel gemakkelijker dan ...