De groep van Jennifer Doudna heeft ontdekt dat CRISPR-Cas12a bruikbaar is voor de opsporing van virus‑DNA. In Science leggen ze uit hoe ze de aanwezigheid van het humaan papillomavirus (HPV) in patiëntenmonsters kunnen aantonen.

Deze nieuwe methode wordt DETECTR (DNA Endonuclease Targeted CRISPR Trans Reporter) genoemd.

Cas12a is een eiwit dat net als Cas9 DNA knipt. Beide eiwitten kunnen op een DNA-sequentie worden gericht. Cas9 knipt alleen de doelsequentie, maar Cas12a werkt anders. Zodra Cas12a zijn doelsequentie heeft geknipt, knipt het al het enkelstrengs DNA in de buurt.

Doudna en collega’s hebben hier nu een toepassing voor gevonden. Een stuk enkelstrengs DNA met een fluorescent label en een fluorescentie-onderdrukkend molecuul werden toegevoegd aan de toediening van Cas12a. Zodra Cas12a zijn doel geknipt had, knipte het ook het meegezonden DNA. Hierdoor kwam het fluorescente label vrij van de onderdrukker en was daardoor te zien. Met deze methode is vast te stellen dat een virale DNA-sequentie in een monster aanwezig is.

Bron: Science