DNA-plakenzym wil liever ijzer dan magnesium

De purperbacterie Ferroplasma acidiphilum heeft een enzym DNA-ligase dat afhankelijk is van ijzer.
Opvallend, want bij andere organismen kan dit enzym, dat losse DNA-strengen weer aan elkaar kan plakken, juist niet zonder magnesium en kalium.

De purperbacterie valt onder de archaeae, een groep bacteriën die al vroeg in de evolutie heeft leren overleven onder extreme omstandigheden. Zo kan de bacterie niet alleen zeer hoge ijzerconcentraties aan, maar zijn zure omstandigheden ook geen probleem.

Duitse wetenschappers van het Helmholtz Zentrum fur Infektionforschung, hebben nu ontdekt dat het DNA ligase zich ook aan deze omstandigheden heeft aangepast. Het blijkt twee Fe3+-tyrosinaat centra te hebben, melden de onderzoekers in PNAS.

Een reductie van het ijzer tot Fe2+ maakte het enzym 80 procent minder actief. Bovendien ligt de optimale activiteit bij een pH van 5, terwijl andere ligases juist het beste presteren bij een pH tussen 6 en 7,5.

Bron: Helmhotz Zentrum for Infektionforschung/PNAS

Onderwerpen