Eiwitten makkelijker te identificeren met nieuw enzym

Dankzij een enzym uit de Japanse paddenstoel Grifola frondosa is het nu mogelijk om eiwitten te identificeren zonder dat het bijbehorende gen bekend is.

Het enzym, een metallo-endopeptidase, knipt eiwitten op aan de N-kant van een lysine. Bekijk je de stukjes eiwit met elektron transfer dissociatie-massaspectrometrie, dan geven langere fragmenten een ander signaal dan korte.

Het enzym is een alternatief voor trypsine, een veelgebruikt verteringenzym dat eiwitten opknipt aan de C-kant van arginines en lysines. Dit enzym levert echter moeilijk te identificeren eiwitfragmenten op.

Voordeel van deze methode is dat je eiwitten kunt analyseren zonder dat je het bijbehorende gen kent, melden Utrechtse onderzoekers in Nature Methods. Handig voor het bestuderen van modificaties die eiwitten ondergaan nadat ze gevouwen zijn.

Bon: UU/Nature Methods