DNA-aptameer

Aptameren leggen reverse transcriptase stil

Synthetische DNA-moleculen (DNA-aptameren) kunnen een enzym dat essentieel voor hiv is in de reageerbuis remmen. Onderzoekers van de University of Missouri beschrijven deze moleculen in Nucleic Acids Research.

Hiv is een zogenaamd retrovirus. Het genetisch materiaal hiervan bestaat uit RNA, dat door het virale enzym reverse transcriptase (RT) wordt omgeschreven naar DNA, nadat het virus een gastheercel is binnengedrongen.

Het artikel beschrijft DNA-moleculen die RT afkomstig van verschillende hiv- en siv-stammen (de apenvariant van het virus) in vitro te kunnen remmen. Uit een eerdere screen van willekeurig gesynthetiseerde DNA-moleculen die aan RT kunnen binden, kwamen 3 aptameren als beste uit de bus.

Deze aptameren zijn 80 nucleotiden lang. De algemene secundaire structuur bestaat uit een ‘stem-loop’ aan het 5’-uiteinde en een ‘quadruplex’ (soort kubus) aan het 3’-uiteinde. De quadruplex is rijk in guanosine-residues; dit zijn guanines gekoppeld aan riboses.

Toekomstig werk moet uitwijzen of de moleculen ook in cellen RT kunnen remmen.

Bron: University of Missouri-Columbia

Onderwerpen