Proteomics – Pagina 6
-
Nieuws
Antibioticum maakt alternatieve eiwitten
Molecular Cell presenteert een nieuwe klasse antibiotica die bacteriën doodt door hun ribosomen in de war te brengen. Daar bestaat vermoedelijk nog geen resistentie tegen, stelt een Frans-Amerikaans samenwerkingsverband dat de werking heeft opgehelderd. Onderzoekers van Nosopharm in Lyon kwamen de zogeheten odilorhabdines (ODL’s) in 2013 op het spoor. ODL’s ...
-
Nieuws
Deuk in eiwit verzwakt celwand
Een holte in het RodA-eiwit vormt een zwakke plek in de bacteriële celwand, meldt Nature. Amerikaanse onderzoekers vermoeden dat het een goed doel is voor nieuwe antibiotica. RodA, een eiwit dat suikers en aminozuren polymeriseert tot de bacteriële peptidoglycaancelwand, werd twee jaar geleden voor het eerst in verband gebracht met ...
-
Nieuws
Hoe bacteriën tolueen maken
Voor het eerst zijn natuurlijke enzymen geïsoleerd die tolueen produceren. Mogelijk hebben we voor zulke basale brandstofcomponenten straks óók geen aardolie meer nodig, schrijft Berkeley-onderzoeker Jay Keasling in Nature Chemical Biology. Dat er tolueenproducerende bacteriekolonies bestaan, met name in zuurstofloze (anoxische) waterbodems, was al meer dan dertig jaar bekend. Maar ...
-
Nieuws
C321.ΔA, daar kun je beter(e) soep van koken
Eiwitten met niet-natuurlijke aminozuren kun je het beste kweken in een extract van zwaar gemodificeerde coli’s. De modificaties voorkomen dat het eigen proteoom van de bacteriën jouw plannen in de weg zit, schrijven Michael Jewett en collega’s van Northwestern University in Nature Communications. Ze hebben het dan over een productiemethode ...
-
Nieuws
Antibiotica uit vogelbekdierenmelk?
Vogelbekdierenmelk bevat een antimicrobieel eiwit met structuurelementen die niet eerder in de natuur zijn aangetroffen. Dat melden Australische onderzoekers die de 3D-structuur van dat eiwit voor het eerst in kaart hebben gebracht. Die antimicrobiële werking van monotreme lactation protein (MLP) heeft hoogstwaarschijnlijk te maken met het feit dat vogelbekdieren geen ...
-
Nieuws
Eiwit als koninginnenlijm
Voorkomen dat de larven van bijenkoninginnen voortijdig uit de raat vallen, is misschien wel de belangrijkste functie van koninginnengelei. Dat schrijven Duitse onderzoekers in Current Biology. Die royal jelly is een uitscheiding uit bepaalde klieren van werkbijen. Ze wordt exclusief gevoerd aan larven die voorbestemd zijn om koningin te worden ...
-
Nieuws
Metaaldetector vindt tumorcel
Metaaldetectie kan nu voor meer worden gebruikt dan schatzoeken. Amerikaanse onderzoekers hebben met metaal gelabelde antilichamen gebruikt om uitgezaaide tumorcellen te vinden, meldt Convergent Science Physical Oncology. Als kanker uitzaait zijn de cellen lastig te volgen. Ook is het van belang om de eigenschappen van deze cellen de weten, omdat ...
-
Nieuws
Ribosomen scheiden werk van privé
Verdeel de eiwitproductie van bacteriën over twee soorten ribosomen, en je kunt voorkomen dat hun eigen prioriteiten die van jou in de weg zitten. Zo kun je de productie van bijvoorbeeld geneesmiddelen verhogen, stellen Engelse onderzoekers in Nature Communications. Zoals bekend verzorgen die ribosomen de vertaling van messenger-RNA naar eiwitten. ...
-
Nieuws
DNA-origami als synthetische kernporie
Dankzij DNA-origami kun je nu synthetische kernporiecomplexen opbouwen waarvan je de samenstelling exact weet. Zo kun je de werking van zo’n complex een stuk gemakkelijker bestuderen, schrijven Cees Dekker en collega’s van de TU Delft en de TU München in Nature Communications. In eukaryote cellen verzorgen die kernporiecomplexen (NPC’s) al ...
-
Nieuws
Klontjes vellen bacterie
Veel bacteriële eiwitten hebben genoeg aan één passende kiem om gezamenlijk te gaan klonteren. Ziedaar de aanzet voor een geheel nieuwe klasse antibiotica, claimen Leuvense onderzoekers in Nature Communications. De ontdekking schept nieuwe perspectieven voor Aelin Therapeutics, een spin-off van het Vlaams Instituut voor Biotechnologie (VIB) die ...
-
Nieuws
Flexibel ionkanaal
In Duitsland is ontdekt dat natrium-kaliumkanalen in celmembranen van vorm kunnen veranderen. Dit is de reden dat ze twee verschillende ionen kunnen doorlaten, meldt Nature Communications. De meeste ionkanalen zijn selectief voor het soort ion dat ze doorlaten. Niet natrium-kaliumkanalen (NaK-kanalen), want die laten zowel natrium als kalium met dezelfde ...
-
Nieuws
Koper gaat fosfaat achterna
Om koperionen binnen te halen gebruiken menselijke mitochondriën hetzelfde eiwit dat fosfaationen door hun membraan transporteert, schrijven Amerikaanse en Canadese onderzoekers in het Journal of Biological Chemistry. De grote vraag is nu hoe dat kán. Dat koper is essentieel voor het COX-eiwitcomplex, dat de laatste schakel vormt in de elektronentransportketen ...
-
Nieuws
CRISPR-Cas schiet doelwit chemotherapie af
Inhibitie van een gen genaamd MELK helpt in het geheel niet tegen kanker. We hebben ons weer eens laten foppen door onvolmaakte laboratoriumtechnieken, claimen Jason Sheltzer en collega’s van het Cold Spring Harbor-lab in eLife. Klinische tests met MELK-inhibitoren kunnen dus beter meteen worden gestopt. Als zo’n medicijn al werkt, ...
-
Nieuws
Panacee tegen zenuwpijn?
Afremmen van het eiwit HDAC6 werkt tegen uiteenlopende vormen van zenuwschade. Of die nu veroorzaakt wordt door genetische foutjes of door chemotherapie, suggereren twee recente Leuvense publicaties. Dat HDAC6 (zie de afbeelding), voluit histon deacetylase 6, veroorzaakt deacetylering van lysinebouwstenen in alfa-tubuline. Dat eiwit is een belangrijk structuurelement in zenuw- ...
-
Nieuws
Computer voorspelt collaterale CRISPR-schade
In Delft is een wiskundig model ontwikkeld dat de kans voorspelt op fouten bij het editen van genen met CRISPR-Cas. Zo kun je een knipplek zoeken met een minimale kans op ongelukjes, schrijven Martin Depken en collega’s in Cell Reports. Die ongelukjes houden in dat het Cas9-knipeiwit niet de unieke ...
-
Nieuws
Flankerend beleid tegen alvleesklierkanker
Spaanse onderzoekers hebben een nieuw doelwit op de korrel voor medicijnen tegen alvleesklierkanker. Je zou een gen genaamd SAA1 moeten uitschakelen. Maar dan alleen in het omringende bindweefsel, stellen ze in PNAS. Ze hebben het dan over een vorm van kanker waartegen, ondanks tientallen jaren intensief onderzoek, nog steeds bijzonder ...
-
Nieuws
Hoe je gefosforyleerde histidines terugvindt
Fosforylering van histidine in eiwitten zou wel eens veel belangrijker kunnen zijn dan tot nu toe werd aangenomen. En dat merk je pas zodra je het daadwerkelijk kunt meten, claimen Utrechtse onderzoekers in Nature Methods. Die fosforylering is een van de manieren waarop eiwitten kunnen reageren op externe veranderingen, om ...
-
Verdieping
Zoals het klokje thuis tikt…
Wel of geen zomertijd; wat politici er ook van denken, onze interne klok trekt zich er weinig van aan. Complexe moleculen drijven de biologische klok aan en niet de mens zelf, hoe graag we dit ook zouden willen. Ruim 24 uur loopt onze biologische klok. Circa diem heet dat in ...
-
Nieuws
Ooit leert deze bacterie hoe hij PET-flesjes maakt
Na een omvangrijke genetische ingreep kunnen Koreaanse coli’s nu glucose omzetten in aromatische polyesters. Ze zouden kunnen uitgroeien tot een alternatief voor Avantiums furanen, suggereert een publicatie in Nature Communications. Tot nu toe waren alleen bacteriën bekend die lineaire polyesters aanmaken, zogeheten polyhydroxyalkanoaten (PHA’s) die ze opslaan als reservevoedsel. Ze ...
-
Nieuws
Opnieuw twijfel aan ware oorzaak alzheimer
Bij de ziekte van Alzheimer sterven zenuwcellen en hun synapsen lang niet zo snel af als tot nu toe werd aangenomen. Dat de hersenfuncties achteruit gaan moet dus haast wel een andere oorzaak hebben, schrijven Franse en Canadese onderzoekers in het tijdschrift Scientific Reports. De groep van Salah El Mestikawy ...