Proteomics – Pagina 11
-
Nieuws
Alzheimer door springende genen
‘Springende genen’ in de mitochondriën zijn mogelijk de ware oorzaak van de ziekte van Alzheimer. En als die hypothese klopt kun je de ziekte in een heel vroeg stadium zien aankomen, schrijven onderzoekers van Duke University in het tijdschrift Alzheimer’s & Dementia. Het zou tevens het vermoeden bevestigen dat de ...
-
Nieuws
Ionkanalen horen je hart kloppen
Roggen en haaien gebruiken een combinatie van twee ionkanalen als extreem gevoelige natuurlijke versterker. Het verklaart waarom deze kraakbeenvissen een prooidier kunnen herkennen aan het oscillerende elektrische veld van de hartspier, schrijft UCSF-onderzoeker David Julius in Nature. Het betreft een calciumkanaal van het type Cav1.3 dat reageert op potentiaalverschillen, en ...
-
Nieuws
Alzheimermuis met menselijke trekjes
Vlaamse onderzoekers hebben bedacht hoe je menselijke neuronen implanteert in de hersenen van een muis met alzheimersymptomen. Zo krijg je misschien wel een beter beeld van menselijke alzheimer dan wanneer je alleen naar die muizenhersens kijkt, claimen Bart De Strooper, Pierre Vanderhaeghen en collega’s van de KU Leuven en het ...
-
Nieuws
Hoe een tumor zijn chemo dumpt
Dankzij cryo-elektronenmicroscopie is nu duidelijk waarom tumoren maar één membraaneiwit nodg hebben om allerlei soorten chemotherapie kunnen lozen. En dus ook hoe je chemo kunt ontwerpen waar dat eiwit geen raad mee weet, schrijven onderzoekers van Rockefeller University in het tijdschrift Cell. Het multidrug resistance protein MRP1 blijkt uit twee ...
-
Nieuws
DNA als eiwittelefoon
Dat DNA elektriciteit geleidt, blijkt essentieel voor de replicatie. Een van de betrokken eiwitten gebruikt het om op het juiste moment een ander uit te schakelen, schrijven Amerikaanse onderzoekers in Science. Het gaat om de replicatie-eiwitten DNA primase en DNA polymerase α. Die bevatten allebei ijzer-zwavelclusters die elektronen kunnen doneren ...
-
Nieuws
Hoe methanogene bacteriën het doen
Eindelijk wordt duidelijk hoe methanogene bacteriën coënzym F430 synthetiseren, een essentieel gereedschap voor de omzetting van koolstofdioxide in methaan. Nu weten we dus ook welke genen je moet transplanteren als je dit coënzym wilt laten aanmaken door een andere soort, blijkt uit een publicatie in Nature. F430 is een organonikkelcomplex ...
-
Nieuws
47 startcodons
Bijna alle drielettercodes in DNA kunnen de aanmaak van een eiwit triggeren, en zogenaamde ‘startcodons’ vergroten alleen de kans dat het gebeurt. Dat valt op te maken uit een publicatie in Nucleic Acids Research, die doet vermoeden dat er weer wat leerboeken de prullenmand in kunnen. Zoals bekend wordt DNA ...
-
Nieuws
TRAP-complex betrapt
Utrechtse onderzoekers beginnen te begrijpen hoe het TRAP-eiwitcomplex werkt. Met dank aan de cryo-elektronenmicroscopie én aan twee mensen bij wie het helaas niet werkt, schrijven ze in Nature Communications. TRAP staat voor translocon-associated protein. Het complex maakt deel uit van een groter geheel, het ER translocon. Dat translocon zit in ...
-
Nieuws
Hoe je methionine labelt
Chemisch biologen en organisch synthetici hebben samen een manier bedacht om selectief de methioninebouwstenen in eiwitten te transformeren tot aanhechtingspunt voor klikchemie. Zo kun je pas echt van alles aan zo’n eiwit hangen zonder de functionaliteit te beïnvloeden, meldt Science. Dat methionine is een van de twee zwavelhoudende aminozuren in ...
-
Nieuws
Bayesiaanse eiwitstructuurbepaling
Cryo-eletronenmicroscoopopnames van eiwitten herleiden tot een 3D-structuur wordt stukken eenvoudiger dankzij twee nieuwe algoritmes. Het kan nu binnen een paar uur op een gewone desktop-pc, beloven Canadese onderzoekers in Nature Methods. Met die ‘cryo-EM’-techniek kun je de structuur bepalen van losse eiwitmoleculen, zonder dat je ze eerst hoeft te laten ...
-
Nieuws
Hoe je een koe verknipt
Met een variant op CRISPR-Cas9 kun je gemodificeerde runderen kweken met bovengemiddelde resistentie tegen rundertuberculose. En dat dit geen detecteerbare neveneffecten oplevert is eigenlijk het grootste nieuws, schrijven Chinese onderzoekers in het tijdschrift Genome Biology. Eerdere pogingen om het rundergenoom te editen met CRISPR-Cas9 leidden juist wél tot neveneffecten. Bijvoorbeeld ...
-
Nieuws
Paddenstoelen veelzijdiger dan gedacht
Genetisch gezien kunnen giftige paddenstoelen veel meer verschillende cyclische peptides aanmaken dan gedacht. En wie weet wat voor nuttige geneesmiddelen daar tussen zitten, schrijven onderzoekers van Michigan State University in BMC Genomics. Jonathan Walton en collega’s ontrafelden voor het eerst het complete genoom van twee soorten: de ook in Nederland ...
-
Nieuws
Nanobuisjes meten eiwitten, een voor een
Met fluorescerende koolstofnanobuisjes kun je een sensor bouwen die in realtime selectief eiwitmoleculen detecteert die door een eencellige worden uitgescheiden. Zonder dat je die eiwitten zelf hoeft te labelen, schrijven MIT- en Berkeley-onderzoekers deze week in Nature Nanotechnology. Voor de herkenning zorgen daarbij aptameren, stukjes enkelstrengs DNA die puur vanwege ...
-
Nieuws
Onmisbare hulpjes in de cel
Zonder chaperonnes is er geen eiwitvouwing mogelijk in de cel. Wat zijn we de laatste jaren te weten gekomen over hun werking, hun rol bij eiwitvouwingsproblemen en de manier waarop ze te ‘targetten’ zijn? ‘Chaperonnes zijn eiwitten en bieden andere eiwitten gedurende hun hele leven de helpende hand’, zegt Sander ...
-
Opinie & Analyse
Noodzakelijke eiwithulpjes
Zonder hulp kom je niet ver in het leven. Al vanaf de geboorte ben je afhankelijk van anderen, voor de opvoeding, om jezelf te ontwikkelen, de taal te leren en een inkomen te krijgen. De hele samenleving zit zo in elkaar, als schakels in een keten en elke persoon heeft ...
-
Verdieping
SUMO: regelneef in de cel
Kleine SUMO-peptides reguleren allerlei processen in de celkern. Hoewel we steeds meer over hun werking en hun rol bij kanker weten, zijn ze zelf maar lastig te (be)grijpen. Elke familie kent er wel één: een regelneef, iemand die gevraagd en ongevraagd alles regelt en naar zijn hand probeert te zetten. ...
-
Nieuws
‘Complexe eiwitten onderzoek ik liever niet alleen’
Biochemicus Arjan Kortholt maakt deel uit van het consortium dat in 2016 de complexe 3D-structuur van het parkinsoneiwit LRRK2 beschreef. Intensieve samenwerking is in zijn ogen hierbij onontbeerlijk. Dat leucine-rich repeat kinase 2 (LRRK2) met ontspoorde kinase-activiteit samenhangt met typische verschijnselen van de ziekte van Parkinson, is al een jaar ...
-
Nieuws
Hoe een eiwit voor Pac-Man speelt
Bacteriën beschikken over transporteiwitten die suikermoleculen letterlijk weghappen alsof ze Pac-Man zijn. Met geavanceerde spectroscopische technieken hebben onderzoekers uit Bonn dit niet keihard bewezen maar wel heel erg aannemelijk gemaakt, schrijven ze in het Biophysical Journal. Hun publicatie gaat over zogeheten tripartite ATP-independent periplasmic transporters, afgekort TRAP, uit Gram-negatieve bacteriën. ...
-
NieuwsEiwitten halogeneren: goed idee
Vervang één waterstofatoom in insuline door jodium, en de stof kan veel sneller door het lichaam worden opgenomen. Het bewijst vooral dat je zulke trucjes ook kunt uithalen met eiwitten en niet alleen met kleine moleculen, schrijven onderzoekers uit Cleveland en Basel in het Journal of Biological ...
-
Nieuws
Antivries-eiwitten beter begrepen
Natuurlijke antivries-eiwitten kunnen werken op twee manieren die heel weinig met elkaar te maken hebben. Zoek je zo’n eiwit voor een bepaalde toepsssing dan moet je daar als eerste naar kijken, schrijven onderzoekers van de TU Eindhoven in PNAS. De publicatie suggereert dat veel collega’s hun kaarten al ...