Proteomics – Pagina 7
-
Nieuws
Computer voorspelt collaterale CRISPR-schade
In Delft is een wiskundig model ontwikkeld dat de kans voorspelt op fouten bij het editen van genen met CRISPR-Cas. Zo kun je een knipplek zoeken met een minimale kans op ongelukjes, schrijven Martin Depken en collega’s in Cell Reports. Die ongelukjes houden in dat het Cas9-knipeiwit niet de unieke ...
-
Nieuws
Flankerend beleid tegen alvleesklierkanker
Spaanse onderzoekers hebben een nieuw doelwit op de korrel voor medicijnen tegen alvleesklierkanker. Je zou een gen genaamd SAA1 moeten uitschakelen. Maar dan alleen in het omringende bindweefsel, stellen ze in PNAS. Ze hebben het dan over een vorm van kanker waartegen, ondanks tientallen jaren intensief onderzoek, nog steeds bijzonder ...
-
Nieuws
Hoe je gefosforyleerde histidines terugvindt
Fosforylering van histidine in eiwitten zou wel eens veel belangrijker kunnen zijn dan tot nu toe werd aangenomen. En dat merk je pas zodra je het daadwerkelijk kunt meten, claimen Utrechtse onderzoekers in Nature Methods. Die fosforylering is een van de manieren waarop eiwitten kunnen reageren op externe veranderingen, om ...
-
Verdieping
Zoals het klokje thuis tikt…
Wel of geen zomertijd; wat politici er ook van denken, onze interne klok trekt zich er weinig van aan. Complexe moleculen drijven de biologische klok aan en niet de mens zelf, hoe graag we dit ook zouden willen. Ruim 24 uur loopt onze biologische klok. Circa diem heet dat in ...
-
Nieuws
Ooit leert deze bacterie hoe hij PET-flesjes maakt
Na een omvangrijke genetische ingreep kunnen Koreaanse coli’s nu glucose omzetten in aromatische polyesters. Ze zouden kunnen uitgroeien tot een alternatief voor Avantiums furanen, suggereert een publicatie in Nature Communications. Tot nu toe waren alleen bacteriën bekend die lineaire polyesters aanmaken, zogeheten polyhydroxyalkanoaten (PHA’s) die ze opslaan als reservevoedsel. Ze ...
-
Nieuws
Opnieuw twijfel aan ware oorzaak alzheimer
Bij de ziekte van Alzheimer sterven zenuwcellen en hun synapsen lang niet zo snel af als tot nu toe werd aangenomen. Dat de hersenfuncties achteruit gaan moet dus haast wel een andere oorzaak hebben, schrijven Franse en Canadese onderzoekers in het tijdschrift Scientific Reports. De groep van Salah El Mestikawy ...
-
Nieuws
Neuronaal eiwit gaat viraal
Neuronen gebruiken een virus-achtige constructie om elkaar boodschapper-RNA door te geven dat codeert voor de bouwstenen van die virus-achtige constructie. Dat blijkt uit twee publicaties die gelijktijdig verschenen in Cell. Die bouwstenen staan bekend als activity-regulated cytoskeleton associated protein, afgekort Arc. Al langer is duidelijk dat dit eiwit essentieel is ...
-
Nieuws
Recept voor koekjes van eigen deeg
In Texas is octrooi aangevraagd op een manier om bacteriën te laten proeven van hun zelfgemaakte peptides. Zo kun je honderdduizenden aminozuurvolgordes tegelijk screenen op antimicrobiële werking, beloven Bryan Davies en collega’s in het tijdschrift Cell. Dat er peptides bestaan die werken als antibioticum, staat vast. Maar het aantal mogelijkheden ...
-
Nieuws
Novo Nordisk wil Ablynx
Novo Nordisk wil voor € 2,6 miljard het Vlaamse biotechbedrijf Ablynx overnemen. Goedschiks of kwaadschiks, laten de Denen weten in een persbericht. De vraag is nu of de aandeelhouders in meerderheid gaan toehappen of dat iemand anders nóg meer biedt voor Ablynx. Een eerste bod van € ...
-
Nieuws
Genetische code met dubbele bodem
Op het oog identieke eiwitten kunnen verschillende functies hebben door verschillen in de onderliggende DNA-code. Tot die verrassende conclusie komen Anna Kashina en collega’s van de University of Pennsylvania in het onlinetijdschrift eLife. Ze hebben het dan over verschillende drielettercombinaties die coderen voor hetzelfde aminozuur. Dat sommige van die codes ...
-
Nieuws
Nieuw doelwit voor ebola-medicatie
Eén enzym van een ebolapatiënt blokkeren moet voldoende zijn om de replicatie van het virus te stoppen. In een celcultuur werkt het alvast, claimen Deense en Duitse onderzoekers in het tijdschrift Molecular Cell. Het enzym (zie de afbeelding) heet PP2A-B56 en is een eiwitfosfatase. Het ebolavirus blijkt het te ‘lenen’ ...
-
Nieuws
Membraaneiwit op chip ruikt voedselbederf
Met een membraaneiwit op een chip kun je waarnemen dat voedsel begint te verrotten, lang voordat je het zelf kunt ruiken. Je kunt er ook dode mensen mee terugvinden na een natuurramp, claimden Koreaanse onderzoekers onlangs in ACS Nano. Hun oriented nanodisc-functionalized bioelectronic nose (ONBN) meet cadaverine (1, 5-pentaandiamine, zie ...
-
Nieuws
Gentherapie verhelpt hemofilie
Voor het eerst lijkt een proef met gentherapie tegen hemofilie A te slagen. Van dertien behandelde patiënten zijn er elf al meer dan een jaar van de medicijnen af. Een van de betrokken artsen noemt het ‘mind-blowing’, meldt de BBC. Bij zulke patiënten is een gen op het X-chromosoom defect ...
-
Nieuws
Hoe planten de fotosynthese dempen
Door carotenoïde-moleculen te vervormen kunnen planten de hoeveelheid energie regelen, die hun chlorofyl te verwerken krijgt. Zo voorkomen ze schade door een teveel aan zonlicht, blijkt uit Amsterdams onderzoek dat zojuist verscheen in Nature Communications. Dát planten heel snel kunnen schakelen als er bijvoorbeeld ineens geen wolk meer voor de ...
-
Nieuws
Ribosoom remt eiwitdiffusie
Hoe snel een eiwit door een cel beweegt, hangt sterk af van de lading. Positief geladen exemplaren blijven namelijk telkens aan de ribosomen hangen, ontdekte de Groningse onderzoeker Bert Poolman. Wellicht is het dus geen wonder dat de industriële productie van sommige van die eiwitten, door genetisch gemodificeerde bacteriën, in ...
-
Nieuws
Genen knippen in de hitte
In een composthoop in Ede is een Cas9-knipeiwit aangetroffen dat functioneert bij temperaturen tot 70 °C. Handig als je thermofiele bacteriën wilt modificeren die bij lagere temperatuur niet gedijen, schrijven John van der Oost en collega’s van Wageningen UR in Nature Communications. Een echte primeur is hun ThermoCas9 helaas niet. ...
-
Nieuws
Hou je resistentie bij je
Door de overdracht van plasmiden in bacteriën te remmen willen onderzoekers van de universiteit van Montreal verspreiding van antibioticaresistentie vertragen. Dit schrijven Christian Baron en collega’s in Scientific Reports. Door plasmiden aan elkaar door te geven kunnen bacteriën de genen die coderen voor resistentie snel verspreiden. Een essentieel eiwit om ...
-
Nieuws
Cholesterol laat virus ontsnappen
Griepvirussen ontsnappen aan de geïnfecteerde gastheercel door te binden met cholesterol in het celmembraan. Dit vertellen onderzoekers van MIT in PNAS. Na infectie van de gastheercel kopieert het virus zich, waarna de kopieën zich verzamelen in een blaasje om de gastheer te verlaten en nieuwe cellen te infecteren. Om deze ...
-
Nieuws
Eiwit verpest zijn eigen synthese
Er zijn DNA-sequenties waar de eiwitsynthese letterlijk op stuk loopt. En dat is ook de bedoeling. E. coli gebruikt dit mechanisme om zijn magnesiumgehalte te regelen, schrijven Japanse onderzoekers in Molecular Cell. Om precies te zijn blijkt het mis te gaan wanneer een ribosoom een stuk of tien ‘zure’ aminozuren ...
-
Nieuws
CRISPR bezorgt Delft iGEM-zege
Met een antibioticaresistentietest voor melkvee hebben studenten van de TU Delft met overmacht de jaarlijkse iGEM-competitie voor synthetische biologie gewonnen. Ze behaalden zowel de Grand Prize als acht hoofdprijzen op afzonderlijke onderdelen, blijkt uit een persbericht. Hun idee heet Case13a en is gebaseerd op CRISPR-Cas, dé grote lifesciencehype van dit ...