Genetica – Pagina 7
-
Nieuws
DNA in nieuwe gedaante
De i-motiefstructuur van DNA, met vier strengen die door cytosines bij elkaar worden gehouden, is een natuurlijk verschijnsel. Met speciaal ontworpen antilichamen wisten Australische onderzoekers haar in vivo te betrappen, schrijven ze in Nature Chemistry. Dat i-motief (zie de afbeelding, met de i van intercalated) lijkt nogal op de G4-structuur, ...
-
Nieuws
Telomeren voor beginners
Lengtebepaling wordt commercieel steeds interessanter. ‘Wij hebben ze geleerd hoe je dit moet doen’, zegt Peter Lansdorp. Hij was de eerste wetenschappelijk directeur van het European Research Institute for the Biology of Ageing (ERIBA) in Groningen, maar is nu weer het grootste deel van de tijd hoogleraar in Vancouver, Canada. ...
-
Nieuws
Knipt CRISPR-Cas kriskras?
Gentechnologie CRISPR-Cas is een bejubelde techniek waarmee je genen snel en nauwkeurig kunt aanpassen. Toch heeft die nauwkeurigheid grenzen. Hoe laat je CRISPR-Cas alleen op de beoogde plek knippen? Als je genen aanpast met CRISPR-Cas is er een kans dat knipeiwit Cas9 verkeerd knipt. Het knipt dan niet de unieke ...
-
Nieuws
Hoe Cas4 in de CRISPR-puzzel past
Zonder het Cas4-eiwit selecteren bacteriën de verkeerde fragmenten uit bacteriofagen-DNA en werkt hun CRISPR-Cas-afweersysteem niet meer. In Cell Reports onthulden Stan Brouns en collega’s van de TU Delft zojuist de rol van dit tot nu toe onbegrepen eiwit dat in ongeveer de helft van alle bekende CRISPR-Casvarianten voorkomt. Dat CRISPR-Cas ...
-
Nieuws
C321.ΔA, daar kun je beter(e) soep van koken
Eiwitten met niet-natuurlijke aminozuren kun je het beste kweken in een extract van zwaar gemodificeerde coli’s. De modificaties voorkomen dat het eigen proteoom van de bacteriën jouw plannen in de weg zit, schrijven Michael Jewett en collega’s van Northwestern University in Nature Communications. Ze hebben het dan over een productiemethode ...
-
Nieuws
Resistentie is Darwin te snel af
Tip voor onkruid: koppel je meest urgente genen los van hun chromosoom en je kunt in recordtijd resistentie opbouwen tegen landbouwgif. Minstens één soort is glyfosaat zo al te slim af geweest, schrijven Bikram Gill en collega’s van Kansas State University in PNAS. Ze ontdekten dat die plant, de tweehuizige ...
-
Nieuws
Hoe CRISPR-Cas9 echt werkt
Twee recente publicaties in JACS geven meer inzicht in het mechanisme van CRISPR-Cas9. Zucai Suo en collega’s bestudeerden de manier waarop Cas9 besluit om DNA te knippen. Daarnaast hebben ze ook gekeken naar wat Cas9 doet nadat het geknipt heeft. Dat CRISPR-Cas9 gericht DNA kan knippen, wisten we al een ...
-
Nieuws
Medici, neem telomeren de maat
Je kunt de lengte van iemands telomeren nauwkeurig genoeg meten om er in een klinische setting iets aan te hebben. In elk geval kun je zo vaststellen of bepaalde symptomen wel of niet worden veroorzaakt door extreem korte telomeren, schrijven Mary Armanios en collega’s van Johns Hopkins Medical Center in ...
-
Nieuws
DNA in een cowboyfilm
Voor het eerst zijn er live-filmbeelden van een condensine-eiwitcomplex dat lussen trekt in DNA. Nu weten we eindelijk zeker hoe dat condensine de dubbele spiraal uit de war haalt tijdens de voorbereiding van een celdeling, schrijven onderzoekers uit Delft en Heidelberg op de website van Science. De groepen van Cees ...
-
Nieuws
CRISPR ontsnapt uit endosoom
In Saudi Arabië hebben onderzoekers ontdekt hoe ze Cas9 en zijn guide RNA kunnen verpakken in een metal-organic framework. Hierdoor komt een groter deel van de Cas9 eiwitten aan in de celkern, meldt JACS. Cellen gebruiken endocytose om het CRISPR-systeem op te nemen. Daarna zitten de CRISPR-onderdelen vast in een ...
-
Nieuws
Neuzen in je genoom
In Nature Genetics presenteren Leuvense en Amerikaanse onderzoekers zeven genen die de vorm van je neus helpen bepalen. Handig als je een gezicht wilt reconstrueren op basis van een schedel, stelt eerste auteur Peter Claes in een persbericht. Zo’n neus bestaat voornamelijk uit kraakbeen en is gewoonlijk allang verdwenen als ...
-
Nieuws
Holmes speurt naar virussen
Het is nu mogelijk om met een papierstrookje op virussen te testen. Amerikaanse onderzoekers kunnen er onder andere dengue en het zikavirus mee identificeren, meldt Science. De groep van Feng Zhang had eerder al SHERLOCK (Specific High Sensitivity Enzymatic Reporter UnLOCKing) ontwikkeld. SHERLOCK gebruikt de CRISPR-eiwitten Cas13 en csm6 om ...
-
Nieuws
CRISPR-Cas12a verklikt vreemd DNA
De groep van Jennifer Doudna heeft ontdekt dat CRISPR-Cas12a bruikbaar is voor de opsporing van virus‑DNA. In Science leggen ze uit hoe ze de aanwezigheid van het humaan papillomavirus (HPV) in patiëntenmonsters kunnen aantonen. Deze nieuwe methode wordt DETECTR (DNA Endonuclease Targeted CRISPR Trans Reporter) genoemd. Cas12a is een eiwit ...
-
Nieuws
Nieuwe CRISPR-Cas9 knipt ook RNA
Een CRISPR-Cas9 uit Neisseria meningitidis, de bacterie die hersenvliesontsteking veroorzaakt, knipt zowel DNA als RNA, meldt Molecular Cell. De CRISPR-eiwitten die tot nu toe ontdekt waren, knipten DNA óf RNA en niet allebei. Amerikaanse onderzoekers bestudeerden de ‘NmeCas9’, omdat deze kleiner is dan andere Cas9-eiwitten en misschien kan binden op ...
-
Nieuws
Lama-immuunsysteem uit de vriezer
In de toekomst zijn lama’s misschien niet meer nodig voor experimenten met lama-antilichamen. In Nature Structural & Molecular Biology beschrijven Amerikaanse onderzoekers hun synthetische lama-immuunsysteem. Lama-antilichamen, ook bekend als nanobodies, zijn kleiner dan antilichamen van andere diersoorten. Hierdoor zijn ze makkelijker te produceren. Ze worden veel gebruikt in onderzoek. Toch ...
-
Verdieping
Het genoom van bloemen en bier
Nanoporie-apparatuur heeft een plek veroverd in het lab, naast gevestigde sequence-technologie. Voor sommige onderzoeksvragen is het zelfs een eerste keuze geworden. Ondertussen kijken onderzoekers of porietechnologie zich leent voor het ontrafelen van eiwitten. ‘Het idee is dat we komend voorjaar, als de tulpen in bloei staan, een eerste versie van ...
-
Nieuws
Worstelen met slecht slapen
De ontdekking van risicogenen voor slapeloosheid doet de hoop op erkenning en behandeling van deze meest voorkomende slaapstoornis weer opleven. ‘Nu kunnen we op zoek gaan naar de biologie van slapeloosheid.’ Iedereen heeft wel eens een slechte nacht, maar slapeloosheid is een ander verhaal. In Nederland lijdt 1 op 10 ...
-
Nieuws
Sequencer zoekt regeneratie-gen
Dankzij nieuwe sequencingtechnieken zijn de genomen van zowel de axolotl als een platworm in kaart gebracht. Wellicht komen we er nu achter waarom beide soorten zo goed zijn in het weer laten aangroeien van afgehakte lichaamsdelen, blijkt uit twee Nature-publicaties vanuit het Max Planck-instituut voor moleculaire celbiologie en genetica in ...
-
Nieuws
Gouddeeltje brengt CRISPR naar tumor
Een nano-gouddeeltje kan een CRISPR pakketje naar het genoom van een tumorcel transporteren. Chinese onderzoekers hopen dit multifunctionele voertuigje in te zetten om tumoren te bestrijden met gentherapie, schrijven ze in Angewandte Chemie. In de tumor-celkern willen ze het gen Plk-1 uitschakelen, waardoor de cel zichzelf vernietigt. Dit kun je ...
-
Nieuws
Antenne voor ammoniumionen
Anammoxbacteriën sporen ammoniumionen op met een eiwit dat als antenne functioneert. Onderzoekers van de Radboud Universiteit leggen in Nature Communications uit hoe het werkt. De ooit in Delft ontdekte bacteriën worden inmiddels wereldwijd ingezet om stikstofverbindingen uit afvalwater te verwijderen. Ze zetten ammonium anaeroob om in stikstofgas. Om te overleven ...